25 maja 1991 r. przyjął święcenia kapłańskie, wtedy też rozpoczął pracę duszpasterską w olsztyńskim kościele Najświętszego Serca Pana Jezusa (1991-1992). Założył i pełnił funkcję kierownika artystycznego zespołów „Tota Corda” (1988-1993), „Humilitas” (1991-1994) oraz „Soli Deo Gloria” (1998-2001). Był również kompozytorem i aranżerem pieśni religijnych.
Ks. Mocarski jest zaangażowany działalność Scholi Cantorum Elbingensis – Elbląskiej Szkoły Kantorów , m.in. prowadząc warsztaty muzyczne. W latach również występował z indywidualnym koncertem i wykładami podczas elbląskich Dni Cecyliańskich. Koncertował również w ramach XXVII Międzynarodowych Giżyckich Koncertów Organowych. Należał do członków Rady Artystycznej oraz jury w kolejnych edycjach Ogólnopolskiego Festiwalu Muzyki Chóralnej im. Feliksa Nowowiejskiego w Barczewie.
W latach 1999-2005 wykładał na Wydziale Teologii Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego w Olsztynie. Kapłan również nauczał muzyki kościelnej w Misyjnym Seminarium Duchownym Księży Werbistów w Pieniężnie.
Pełnił funkcję organisty pontyfikalnego przy Konkatedrze św. Jakuba w Olsztynie. Od 2000 r. współpracował z Chórem im. profesora Wawrzyczka w Olsztynie.